L’école propose plusieurs diplômes de Master (niveau bac+5).
Diplômes de Master délivrés par l’ENSFEA
- Master Métiers de l’Enseignement de l’Éducation et de la Formation pour l’Enseignement Agricole (MEEF) Mention Enseignant du second degré
- Master Métiers de l’Enseignement de l’Éducation et de la Formation pour l’Enseignement Agricole (MEEF) Mention Encadrement éducatif
- Master Mention Économie du travail et des ressources humaines
Diplômes de Masters co-accrédités avec des Universités et/ou Écoles toulousaines
- Master Mention Sciences et technologies de l’agriculture, de l’alimentation et de l’environnement
- Parcours – Master of sciences and technology Agrofood Chain (MOST-AFC)
- Master Mention Gestion des territoires et développement local
- Parcours Ruralités dans les Nords et les Suds